Shotgun（鸟枪法）蛋白质混合物鉴定
Shotgun（鸟抢法）蛋白质混合物鉴定的基本原理是蛋白质溶液或经过SDS-PAGE分离的蛋白质条带经过酶解后形成肽段混合物，肽段混合物经过一维液相色谱或二维液相色谱分离，串联质谱检测，然后通过在相应的数据库中检索，从而鉴定蛋白质
药物代谢组学检测分析
药物代谢组学同样以整体和动态的观点来认识、解释、进而预测个体对药物治疗的效应，它们的发展将有力推动个性化治疗，尤其是两者与中医学的辨证施治思想相结合，
Label-Free蛋白质相对定量分析
Label-Free是近年来重要的质谱定量方法，通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化。该技术无需昂贵的同位素标签做内标，提高了低丰度蛋白质的检测效率和蛋白质定量的准确性。